No âmbito aeronáutico a JST investiga todos os acontecimentos de aviação civil, sejam acidentes ou incidentes, que ocorram no território da República Argentina, seu espaço aéreo e suas águas jurisdicionais e que cause a morte ou lições graves, danos estruturais às aeronaves ou desaparição ou total inacessibilidade das mesmas. Uma vez concluído o processo de investigação e análise do acontecimento, a JST realiza o controle das medidas de seguridade operacional implementadas.